CAZypedia needs your help!
We have many unassigned pages in need of Authors and Responsible Curators. See a page that's out-of-date and just needs a touch-up? - You are also welcome to become a CAZypedian. Here's how.
Scientists at all career stages, including students, are welcome to contribute.
Learn more about CAZypedia's misson here and in this article.
Totally new to the CAZy classification? Read this first.

Glycoside Hydrolase Family 19

From CAZypedia
Revision as of 13:55, 25 March 2010 by Vincent Eijsink (talk | contribs)
Jump to navigation Jump to search
Under construction icon-blue-48px.png

This page is currently under construction. This means that the Responsible Curator has deemed that the page's content is not quite up to CAZypedia's standards for full public consumption. All information should be considered to be under revision and may be subject to major changes.


Glycoside Hydrolase Family GHnn
Clan GH-x
Mechanism retaining/inverting
Active site residues known/not known
CAZy DB link
http://www.cazy.org/fam/GHnn.html


Substrate specificities

Content is to be added here.

This is an example of how to make references to a journal article [1]. (See the References section below). Multiple references can go in the same place like this [1, 2]. You can even cite books using just the ISBN [3]. References that are not in PubMed can be typed in by hand [4].


Kinetics and Mechanism

Content is to be added here.


Catalytic Residues

Content is to be added here.


Three-dimensional structures

  Normal  0            false  false  false    EN-US  X-NONE  X-NONE                                       MicrosoftInternetExplorer4

The catalytic domains of family 19 chitinases have a lysozyme-like fold with rather shallow substrate-binding grooves that are not particularly rich in aromatic residues (see Figure). The catalytic domains of family 19 chitinases share a common fold with family 46 chitosanases and with lysozymes in families 22, 23 and 24 of glycoside hydrolases ADDIN EN.CITE ADDIN EN.CITE.DATA 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 (Holm and Sander, 1994; Hart et al., 1995; Monzingo et al., 1996) 3C456E644E6F74653E3C436974653E3C417574686F723E486172743C2F417574686F723E3C596561723E313939353C2F596561723E3C5265634E756D3E3237303C2F5265634E756D3E3C7265636F72643E3C7265632D6E756D6265723E3237303C2F7265632D6E756D6265723E3C666F726569676E2D6B6579733E3C6B6579206170703D22454E222064622D69643D22663061307A74776632737366323765703064637077776678767464727465773073327772223E3237303C2F6B65793E3C2F666F726569676E2D6B6579733E3C7265662D74797065206E616D653D224A6F75726E616C2041727469636C65223E31373C2F7265662D747970653E3C636F6E7472696275746F72733E3C617574686F72733E3C617574686F723E486172742C20502E204A2E3C2F617574686F723E3C617574686F723E50666C756765722C20482E20442E3C2F617574686F723E3C617574686F723E4D6F6E7A696E676F2C20412E20462E3C2F617574686F723E3C617574686F723E486F6C6C69732C20542E3C2F617574686F723E3C617574686F723E526F6265727475732C204A2E20442E3C2F617574686F723E3C2F617574686F72733E3C2F636F6E7472696275746F72733E3C617574682D616464726573733E556E69762054657861732C44657074204368656D2026616D703B2042696F6368656D2C41757374696E2C54782037383731323C2F617574682D616464726573733E3C7469746C65733E3C7469746C653E3C7374796C6520666163653D226E6F726D616C2220666F6E743D2264656661756C74222073697A653D2231303025223E54686520726566696E6564206372797374616C2D737472756374757265206F6620616E20656E646F63686974696E6173652066726F6D203C2F7374796C653E3C7374796C6520666163653D226974616C69632220666F6E743D2264656661756C74222073697A653D2231303025223E486F726465756D2076756C676172653C2F7374796C653E3C7374796C6520666163653D226E6F726D616C2220666F6E743D2264656661756C74222073697A653D2231303025223E204C20736565647320617420312E3820416E677374726F6D207265736F6C7574696F6E3C2F7374796C653E3C2F7469746C653E3C7365636F6E646172792D7469746C653E4A6F75726E616C206F66204D6F6C6563756C61722042696F6C6F67793C2F7365636F6E646172792D7469746C653E3C616C742D7469746C653E4A204D6F6C2042696F6C262378443B4A204D6F6C2042696F6C3C2F616C742D7469746C653E3C2F7469746C65733E3C706572696F646963616C3E3C66756C6C2D7469746C653E4A6F75726E616C206F66204D6F6C6563756C61722042696F6C6F67793C2F66756C6C2D7469746C653E3C616262722D313E4A204D6F6C2042696F6C3C2F616262722D313E3C616262722D323E4A2E204D6F6C2E2042696F6C2E3C2F616262722D323E3C2F706572696F646963616C3E3C70616765733E3430322D3431333C2F70616765733E3C766F6C756D653E3234383C2F766F6C756D653E3C6E756D6265723E323C2F6E756D6265723E3C6B6579776F7264733E3C6B6579776F72643E6372797374616C207374727563747572653C2F6B6579776F72643E3C6B6579776F72643E726566696E656D656E743C2F6B6579776F72643E3C6B6579776F72643E782D72617920616E616C797369733C2F6B6579776F72643E3C6B6579776F72643E656E646F63686974696E6173653C2F6B6579776F72643E3C6B6579776F72643E7375627374726174652062696E64696E673C2F6B6579776F72643E3C6B6579776F72643E616E746966756E67616C2070726F706572746965733C2F6B6579776F72643E3C6B6579776F72643E61726561206465746563746F723C2F6B6579776F72643E3C6B6579776F72643E77686561742D6765726D3C2F6B6579776F72643E3C6B6579776F72643E63686974696E6173653C2F6B6579776F72643E3C6B6579776F72643E70726F7465696E3C2F6B6579776F72643E3C6B6579776F72643E707572696669636174696F6E3C2F6B6579776F72643E3C6B6579776F72643E6C79736F7A796D653C2F6B6579776F72643E3C6B6579776F72643E706C616E74733C2F6B6579776F72643E3C6B6579776F72643E64696666726163746F6D657465723C2F6B6579776F72643E3C6B6579776F72643E616363756D756C6174696F6E3C2F6B6579776F72643E3C2F6B6579776F7264733E3C64617465733E3C796561723E313939353C2F796561723E3C7075622D64617465733E3C646174653E5365703C2F646174653E3C2F7075622D64617465733E3C2F64617465733E3C616363657373696F6E2D6E756D3E4953493A4131393935515634313330303031383C2F616363657373696F6E2D6E756D3E3C6C6162656C3E41636164656D696320507265737320284C6F6E646F6E29204C74643C2F6C6162656C3E3C75726C733E3C72656C617465642D75726C733E3C75726C3E266C743B476F20746F204953492667743B3A2F2F4131393935515634313330303031383C2F75726C3E3C2F72656C617465642D75726C733E3C2F75726C733E3C2F7265636F72643E3C2F436974653E3C436974653E3C417574686F723E4D6F6E7A696E676F3C2F417574686F723E3C596561723E313939363C2F596561723E3C5265634E756D3E3237313C2F5265634E756D3E3C7265636F72643E3C7265632D6E756D6265723E3237313C2F7265632D6E756D6265723E3C666F726569676E2D6B6579733E3C6B6579206170703D22454E222064622D69643D22663061307A74776632737366323765703064637077776678767464727465773073327772223E3237313C2F6B65793E3C2F666F726569676E2D6B6579733E3C7265662D74797065206E616D653D224A6F75726E616C2041727469636C65223E31373C2F7265662D747970653E3C636F6E7472696275746F72733E3C617574686F72733E3C617574686F723E4D6F6E7A696E676F2C20412E20462E3C2F617574686F723E3C617574686F723E4D6172636F7474652C20452E204D2E3C2F617574686F723E3C617574686F723E486172742C20502E204A2E3C2F617574686F723E3C617574686F723E526F6265727475732C204A2E20442E3C2F617574686F723E3C2F617574686F72733E3C2F636F6E7472696275746F72733E3C617574682D616464726573733E556E69762054657861732C44657074204368656D2026616D703B2042696F6368656D2C41757374696E2C54782037383731323C2F617574682D616464726573733E3C7469746C65733E3C7469746C653E43686974696E617365732C20636869746F73616E617365732C20616E64206C79736F7A796D65732063616E206265206469766964656420696E746F2070726F636172796F74696320616E64206575636172796F7469632066616D696C6965732073686172696E67206120636F6E73657276656420636F72653C2F7469746C653E3C7365636F6E646172792D7469746C653E4E6174757265205374727563747572616C2042696F6C6F67793C2F7365636F6E646172792D7469746C653E3C616C742D7469746C653E4E6174205374727563742042696F6C262378443B4E6174205374727563742042696F6C3C2F616C742D7469746C653E3C2F7469746C65733E3C706572696F646963616C3E3C66756C6C2D7469746C653E4E6174757265205374727563747572616C2042696F6C6F67793C2F66756C6C2D7469746C653E3C616262722D313E4E6174205374727563742042696F6C3C2F616262722D313E3C616262722D323E4E61742E205374727563742E2042696F6C2E3C2F616262722D323E3C2F706572696F646963616C3E3C70616765733E3133332D3134303C2F70616765733E3C766F6C756D653E333C2F766F6C756D653E3C6E756D6265723E323C2F6E756D6265723E3C6B6579776F7264733E3C6B6579776F72643E626163746572696F70686167652D74343C2F6B6579776F72643E3C6B6579776F72643E62696E64696E673C2F6B6579776F72643E3C6B6579776F72643E68656E3C2F6B6579776F72643E3C2F6B6579776F7264733E3C64617465733E3C796561723E313939363C2F796561723E3C7075622D64617465733E3C646174653E4645423C2F646174653E3C2F7075622D64617465733E3C2F64617465733E3C616363657373696F6E2D6E756D3E4953493A4131393936545436373430303031303C2F616363657373696F6E2D6E756D3E3C6C6162656C3E4E6174757265205075626C697368696E6720436F3C2F6C6162656C3E3C75726C733E3C72656C617465642D75726C733E3C75726C3E266C743B476F20746F204953492667743B3A2F2F4131393936545436373430303031303C2F75726C3E3C2F72656C617465642D75726C733E3C2F75726C733E3C2F7265636F72643E3C2F436974653E3C2F456E644E6F74653E . For a long time, structural information for these chitinases was limited to the structures of two class II plant enzymes ADDIN EN.CITE ADDIN EN.CITE.DATA 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 (Hart et al., 1993; Hahn et al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ecently, the structures of bacterial family 19 chitinases have become available (Hoell et al., 2006; Kezuka et al., 2006, class IV), as well as the structures of class I (Ubhayasekera et al. 2007) and class IV (Ubhayasekera et al. 2009) GH19 chitinases from plants.


The structures of bacterial GH19 chitinases revealed several differences from the previously reported plant structures (Hoell et al., 2006; Kezuka et al., 2006; see Figure). Compared to plant enzymes, the bacterial enzymes lack a C-terminal extension and three loops, some of which are thought to be flexible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bhayasekera et al., 2007; Fukamizo et al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


There is no structural information for GH19 enzymes in complex with their substrate. In 2008, Huet et al published the structure of a complex of papaya family 19 chitinase with GlcNAc units bound in the -2 and +1 subsites. This structure has been used to build a plausible model of a complex with (GlcNAc)4. This is the first structure (half experimental, half modeled) of an enzyme-substrate complex.


Family Firsts

First primary sequence determination: Bean leaf chitinase (Broglie et al., 1986)

First stereochemistry determination: Yam chitinase, by NMR (Fukamizo et al., 1995) and Bean chitinase, by HPLC (Iseli et al., 1996)

First general base residue identification: Chitinase from barley; determination by site-directed mutagenesis (Andersen et al., 1997), structural analysis (Hart et al., 1993) and modelling (Brameld and Goddard, 1998). Additional support from structure determination and modelling of a papaya chitinase (Huet et al., 2008).

First general acid residue identification: Chitinase from barley; determination by site-directed mutagenesis (Andersen et al., 1997), structural analysis (Hart et al., 1993) and modelling (Brameld and Goddard, 1998). Additional support from structure determination and modelling of a papaya chitinase (Huet et al., 2008).

First 3-D structure: Barley chitinase (Hart et al., 1993).

References

  1. []